药学院高度重视学生工作队伍建设，全面落实教育部关于加强高校辅导员队伍建设的各项工作要求。学院学工团队共11人，包括总支书记1人，学生秘书1人，专职辅导员7人，兼职辅导员2人。团队成员硕士以上学历11人，讲师以上职称6人，平均年龄34岁，是一支政治过硬素质优良的工作队伍。学院党总支积极构建立德树人，培根铸魂“1344”工作机制，以培根铸魂为核心点，以三全育人为着力点，以队伍建设为关键点，围绕高校立德树人根本任务，坚持以学生为本，全面提升学生素质能力，促进学生成长成才。2022年被安徽省委宣传部授予“安徽省基层思想政治工作示范点”。

近年来，团队成员获得全国高校辅导员职业能力大赛三等奖，安徽省职业院校教师教学能力大赛一等奖，安徽省高校思想政治理论课教师党史说课暨教学展示三等奖，省级教学成果奖二等奖等。所带班级荣获“全国活力团支部”、省直机关优秀团支部等荣誉称号。学生获得全国大学生英语写作大赛三等奖，全国百佳心理委员，全国百佳心理剧本，安徽省大学生互联网+创业大赛金奖、银奖，安徽省“创青春”大学生创业大赛银奖、安徽省大学生课外学术科技作品竞赛一等奖、安徽省职业院校技能大赛一等奖、二等奖、安徽省大学生计算机设计大赛三等奖、安徽省委直机关“优秀共青团员”、“优秀志愿者”等奖项。